期刊中心主要承担《云南财经大学学报》《沿边金融研究》的出版发行工作。其中，《云南财经大学学报》是由云南财经大学主办的财经类学术理论期刊，主管单位为云南省教育厅。该期刊于1985年2月创刊，面向国内外公开发行，为月刊，每期有110个页码。其原刊名为《云南财贸学院学报》，2006年更改为现名。目前，该刊主要开设了理论探讨、国民经济、金融研究、管理论坛等栏目。近年来，《云南财经大学学报》的学术声誉显著提升，现为全国中文核心期刊、全国高校百强社科期刊、CSSCI来源期刊（含扩展版）、中国核心学术期刊。2025年，国家新闻出版署正式批复《时代金融》（原《云南金融》）更名为《沿边金融研究》，由期刊中心与金融学院联合办刊。截止2026年1月，期刊中心共有9人，其中教授2名，副编审2人，中级职称人员1人，编外人员4人。

近年来，学报论文的学术水平、编校质量稳步提升，被引率、转载率稳步上升，学术影响不断扩大。《云南财经大学学报》2025年再次入选CSSCI（2025-2026）扩展版来源期刊。《云南财经大学学报》的复合影响因子和综合影响因子再创历史新高。《云南财经大学学报》2024年复合影响因子为6.098，相较2023年4.994上升22.10%。综合影响因子为3.006，相较2023年2.596上升15.79%。复合类他引影响因子比2023年上升22.53%。在全国92种“经济科学综合学科”类期刊中，《云南财经大学学报》的影响因子学科排名第32位，影响力指数CI值学科排序全国第34位，位居全国“经济科学综合学科”类期刊前列。